人体微生态整体研究技术

人体微生态研究的对象是人体内(粪便标本,体液标本等)所有病毒、细菌、真菌、寄生虫等微生物的总和。人体微生态系统包括肠道微生态、口腔与呼吸道、皮肤微生态和生殖道微生态四个微生态系统。微生态研究的数据结合样本信息后(疾病状态,生理生化特征等),通过数据分析得到微生态信息,研究者使用这些信息进行临床决策(或发表论文)。

以琳生物专注人体微生态系统和医学健康之间的关联性,为客户提供整套的人体微生态研究方案:涵盖实验的前期规划,样本收集、保存方法,组学分析,预实验与效果评估,实验及数据分析与解析,助力科研。

 
 

 

肠道微生态

 

肠道微生物也就是我们所说的“肠道菌群”,正常人体肠道菌群种类超过40,000种,数量高达100万亿,是人体细胞数量的10倍。肠道菌群对营养物质代谢、人体自身发育、免疫及疾病的产生等方面都起到极其重要的作用。很多研究结果都表明肠道微生物和90%的疾病发病直接相关。

 

目前已经证实,和肠道菌群相关的疾病研究多为以下六大类:1)消化道类疾病,2)代谢性疾病;3)肝脏类疾病;4)免疫类疾病,5)肺部疾病;6)精神类疾病。

 

 

 

服务内容

 

1研究样本中微生物的种类及其对应的丰度

 

肠道菌群和疾病关联性分析,并鉴定出与疾病相关的物种、基因、功能marker

药物或饮食干预前、后等不同干预阶段的肠道菌群的差异

同一群体多个身体部位(粪便、唾液、牙菌斑等样本)的微生物

2宏基因组学、宏转录组学、多组学分析

 

肠道菌群宏基因组、空腹血清代谢组与表型关联分析

 

肠道菌群宏基因组与人体蛋白质组学或代谢组学关联分析研究肠道菌群在人体相关蛋白表达或代谢途径中的作用

3通过厌氧培养获得样本中微生物的菌株

 

在动物实验和细胞实验水平上研究某一肠道细菌在肿瘤发生中的作用及作用机制

 

 

样本采集

 

新鲜样品采集:
(1)粪便:人粪便采集新鲜的、中后段、内部的粪便样本,小鼠和大鼠可采用代谢笼采集新鲜粪便,每个样本需1g。
(2)肠粘膜样本:粘膜相关菌群可能与肠道正常功能和疾病关联度更高,但操作技术比较复杂,如宿主污染严重,样本量少等。

 

 

样本要求

 

DNA样品:浓度大于10 ng/L,总量大于500 ng的基因组DNA;DNA纯度较差或降解会影响后继的扩增实验,建议提供电子版DNA电泳检测照片及 OD260/280的比值。

 

 

样本运送

 

送样时采用干冰保存运输;若是距离较远,建议采用干冰加冰袋,存放于冰盒中。
备注:采好后立刻冻存于-80℃冰箱,保存期间切记反复冻融。

 

 

研究方案

 

 

 

口腔与呼吸道

 

口腔是人体微生物定植生存的重要生态区,口腔微生物不仅有细菌,还包括真菌、病毒、螺旋体及古细菌等。正常情况下口腔微生物群落之间、微生物与宿主之间密切且复杂的相互作用维持着宿主健康,这种生态平衡被打破将会引发疾病。口腔主要疾病如龋病、牙周病及口腔癌等严重影响人类的生命健康。

 

 

样本采集

唾液样品:采样前2小时内不可饮食、饮水、吸烟、刷牙。
DNA样品:浓度大于10 ng/L,总量大于500 ng的基因组DNA;DNA纯度较差或降解会影响后继的扩增实验,建议提供电子版DNA电泳检测照片及 OD260/280的比值。
样品运送:送样时采用干冰保存运输;若是距离较远,建议采用干冰加冰袋,存放于冰盒中。
备注:采好后立刻冻存于-80℃冰箱,保存期间切记反复冻融。

 

 

皮肤微生态

 

从公元前400年,希波克拉底第一次描述念珠菌感染起,研究者们一直在探寻与人类共生的真菌和细菌对人体健康及疾病的影响。皮肤作为人体最大的器官拥有达1.8m的表面积,其主要功能是作为物理屏障,保护机体免受外来生物或有毒物质的侵害。同时,皮肤也是人体与外界环境接触的部位,因此常驻有各类微生物,包括细菌、真菌、病毒等。各类微生物和皮肤表面的组织、细胞及各种分泌物微环境等共同组成的整体,维持微生物群落与皮肤表面组织之间的平衡。这种平衡一旦被打破,就可能会引起皮肤病或感染。

 

 

样本采集

新鲜样品:按照实验规划,收集相应样品。
DNA样品:浓度大于10 ng/L,总量大于500 ng的基因组DNA;DNA纯度较差或降解会影响后继的扩增实验,建议提供电子版DNA电泳检测照片及 OD260/280的比值。
样品运送:送样时采用干冰保存运输;若是距离较远,建议采用干冰加冰袋,存放于冰盒中。
备注:采好后立刻冻存于-80℃冰箱,保存期间切记反复冻融。

 

 

生殖道微生态

 

生殖道微生态环境对妇女健康、生殖功能、婴儿出生等都有重要的作用。微生物导致生殖道环境产生某些生化或炎症反应,生育期健康女性的阴道内有大量正常寄生菌,他们通过自身产生的粘附机制与阴道上皮细胞结合,生长于阴道粘膜表面。其菌群的平衡至关重要,其不仅影响着其中定殖微生物类群,也影响着阴道内环境。而一旦受到某些因素的影响,如体内雌激素含量的变化、致病菌的侵入、长期服用抗生素等,就会使阴道pH值发生改变,破坏阴道的自然防护,其内部的菌群失衡,就会产生相应的疾病。

 

 

样本采集

新鲜样品:用无菌棉拭子,于女性阴道侧壁1/3处取阴道分泌物,将棉签置于无菌管中,保存于-80℃冰箱中。
DNA样品:浓度大于10ng/ml,总量大于300 ng的基因组DNA;DNA纯度较差或降解会影响后继的扩增实验,建议提供电子版DNA电泳检测照片及 OD260/280的比值。
样品运送:送样时采用干冰保存运输;若是距离较远,建议采用干冰加冰袋,存放于冰盒中。
备注:采好后立刻冻存于-80℃冰箱,保存期间切记反复冻融。

Copyright © 无锡艾尔诺生物技术有限公司 版权所有     苏ICP备13053571号