宏转录组学

 

宏转录组测序技术(Metatranscriptomic sequencing)通过对特定时期、特定环境样品中所有微生物群落的转录本进行大规模高通量测序,可以直接获得环境中可培养和不可培养的微生物转录组信息。

 

 

服务内容

 

以琳生物利用二/三代测序平台,可以进行人体微生态环境中的活性微生物、活性转录本以及活性功能进行研究,还可以比较不同环境下的差异表达基因和差异功能途径,揭示微生物在不同人体状态下的适应机制,探索人体微生态与微生物之间的互作机理。

 

 

技术平台

 

Illumina HiSeq 2000/3000

 

 

技术路线

 

 

 

结果示例


转录组文库中mRNA和rRNA的分类组成

 

Wt con,野生型对照小鼠;wt DSS,DSS诱导肠道炎症小鼠;STAT1-/- con,STAT1敲基因小鼠;STAT1-/- DSS,DSS诱导STAT1小鼠肠道炎症。

 

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