1.共生菌和致病菌与肠道黏障间的膜屏互作 （标题：Interactions of commensal and pathogenic microorganisms with the intestinal mucosal barrier）

Nature Reviews Microbiology[IF:26.819]

（1） 人类肠道中有多种菌群共存，肠道共生菌通过酵解膳食纤维生成短链脂肪酸，供给肠道细胞能量；

（2）肠道细胞分泌的黏液覆盖上皮粘膜层，进而构成肠粘膜屏障；另外，黏液中含有的IgA和抗菌肽可抵御有害共生菌和病原体入侵；

（3）肠道致密共生菌抵御病原体入侵，而肠蠕动和附着性促进病原体定殖；此外，肠道菌群组成或生理改变破坏肠粘膜屏障完整性；

（4）致病菌的入侵策略包括：利用上皮细胞谱系、分泌酶降解粘液并破坏紧密连接、破坏粘液层和粘液生成。

 

2. 肠道菌群与代谢疾病的研究进展、机制和陷阱（标题：Human gut microbiome: hopes, threats and promises）

Gut[IF:16.658]

（1）代谢疾病中，基因、食物和药物均可影响菌群组成和数量、代谢产物和免疫间的平衡；

（2）肠道菌群组成直接影响肠道黏液层厚度、抗微生物信号和短链脂肪酸生成；

（3）丙酸和丁酸通过作用于G蛋白偶联受体，促进L细胞生成肠肽调节能量摄入和血糖，影响MAIT和Treg等免疫细胞，并激活PPAR-γ以维持肠道厌氧环境，最终影响肠道屏障功能；

（4）粪便普雷沃氏菌和Akk菌的研究提示，特定细菌的作用可能受多种因素影响。

 

3.寄生虫-菌群的互作（标题：Helminth–Bacterial Interactions: Cause and Consequence）

Trends in Immunology[IF:13.287]

（1）寄生虫感染通过促进警报素（IL-25、IL-33、TSLP）的释放，触发宿主的2型免疫反应；

（2）随后2型天然淋巴细胞活化，树突细胞成熟，Th2细胞分泌细胞因子促进B细胞分化并产生IgG及IgE抗体，M2巨噬细胞及嗜酸性粒细胞产生效应因子杀伤寄生虫；

（3）寄生虫可能通过调节黏液分泌、肠道运动、黏蛋白糖基化、肠道pH值、肠道上皮损伤等改变肠道菌群；

（4）寄生虫产物或虫卵可直接与肠道菌群互作，例如几丁质可作为特定菌种的底物或信号分子。

 

4. 噬菌体与共生菌群和宿主免疫的互作（标题：Close Encounters of Three Kinds: Bacteriophages, Commensal Bacteria, and Host Immunity）

Trends in Microbiology[IF:11.02]

（1）病毒组影响人类生理活动，其数量最多的组分是噬菌体；

（2）噬菌体调节病毒、细菌、菌群与原核及真核生物宿主的相互作用；

（3）噬菌体大部分基因转录在原噬菌体中被抑制，经细菌复制裂变分离，DNA损伤、其他刺激及基因表达随机波动可诱导原噬菌体基因组的去阻抑、切除和复制；

（4）在体内，噬菌体对微生物构成和功能的作用，是否及如何调节细菌共生适应性，噬菌体之间及与真核生物的相互作用，机体免疫系统对噬菌体的影响和调节仍需研究。

 

5. 炎性肠病治疗中的生物制剂（标题：The current state of the art for biological therapies and new small molecules in inflammatory bowel disease）

Mucosal Immunology[IF:7.478]

（1）现有及在研中的治疗IBD的生物制剂包括：β7、α4、α4β7等整合素拮抗剂、IL-12/23 (p40)拮抗剂、IL-23 (p19)拮抗剂、TNF拮抗剂；

（2）临床治疗中使用生物制剂，应注意以下问题：避免产生抗药物的抗体、对体内药物水平进行监测、使用免疫调节剂进行联合治疗、疾病早期使用生物制剂的影响等；

（3）一些新的生物制剂包括：抗MAdCAM药物/新型抗整合素药物等白细胞迁移阻断剂、JAK抑制剂、SIP-1抑制剂、磷酸二酯酶4抑制剂、SMAD7抑制剂等。

 

6. 宏基因组学助力海洋微生物研究（标题：Metagenomics Sheds Light on the Ecology of Marine Microbes and Their Viruses）

Trends in Microbiology[IF:11.02]

（1）结合shotgun宏基因组、单细胞基因组、代谢组等多组学技术手段，可对海洋微生物进行系统发育学、生态基因组学、共现网络分析；

（2）基于组学的方法可深入研究新分类群在生物地球化学循环及其它生态系统维持过程中的作用；

（3）目前，生态基因组学分析大多关注透光层中的蓝细菌及SAR11；

 

（4）通过宏基因组学分析揭示海洋病毒对宿主群落的广泛影响，例如裂解病毒杀伤宿主后，释放营养物质供其它微生物竞争者利用，并释放大量碳元素影响全球碳循环。